Kontroll Analyse

Verglichen mit der Sequenzanalyse ist die Fragmentanalyse aufwendiger. Bei der Fragmentanalyse muss anders als bei der Sequenzanalyse die Größe (in bp) eines DNA-Fragments bestimmt werden. Dies kann in guter Qualität nur durch die interne Kalibration mit DNA-Fragmenten bekannter Länge (Size Standard) erfolgen. Die endgültige Allelbezeichnung erhält man danach durch Vergleich mit einem weiterem Standard, der Allelleiter. Allelleitern, Positiv- und Negativkontrollen werden separiert von den zu typisierenden Proben ausgewertet und grafisch dargestellt.

Mit verschiedenen, ausgefeilten Routinen kann nun die Information der Kontrollproben (Allelleiter, Positivkontrolle, Profile der Labormitarbeiter) zum Allel Calling der unbekannten Proben verwendet werden. Dabei können z.B. die Allelleiterpeakpositionen in der Datenbank automatisch an die tatsächlichen Messwerte angepaßt werden. Zeitabhängige Verän-derungen der Messwerte sind über die Differenz erwartet-gemessen zugänglich. Binweiten und Farben der Bindarstellung sind konfigurierbar.