Fragmentanalyse / Genotyping

Wie unter dem Eintrag Kontrol System beschrieben, wird die Allelzuordnung mit Hilfe von Allelleiterpeakpositionen vorgenommen. Für beliebige Allelleitern kann eine Datenbankdatei eingerichtet werden, die für weitere Analysen benutzt wird. Eine Reihe von Möglichkeiten ermöglichen dann ein verbessertes Allele Calling.

Die Datenbank bp-Werte können aus einzelnen Allelleitern oder in Form eines Mittelwertes über mehrerer Allelleitern generiert werden. Diverse grafische Darstellungsmöglichkeiten erleichtern das Verständnis der Zusammenhänge von PCR-Reaktion und der Performance des Sequencers. Dadurch ergeben sich neue Möglichkeiten in der Beurteilung der Qualität der gemessenen Daten, die sich dann auch für Optimierungen der einzelnen Stationen: DNA-Isolation, PCR-Reaktion (Amplifikation) und Detektion einsetzen lassen.